Wiley 天然产物标识符 – AntiBase 库 + ChemWindow (Wiley Identifier of Natural Products – AntiBase Library + ChemWindow)

技术 筛选数据库

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概述

一个天然产物数据库

适用于化合物筛选和其他天然化合物研究应用

Wiley Identifier of Natural Products(AntiBase Library + ChemWindow®)是一个全面的天然产物数据库,涵盖58,000多种化合物

这个数据库最初由Hartmut Laatsch博士开发,是代谢组学和药物发现领域的高效筛选工具,在这两个领域中天然产物和衍生物可以加速癌症、糖尿病、疾病以及抗菌或抗真菌研究等方面的治疗;这一数据库目前仍在不断发展壮大。

它可以用于高通量筛选(HTS)去重复工作流程,以快速识别化合物,进而快速识别已经研究过的化合物,缩小具有抗菌或预期效果的新化合物的可能范围。

此外,这个天然产物数据库可用于各行各业,如食品、化妆品农业杀虫剂以及天然产物普遍存在的其他应用,也可用于学术项目和研究

Wiley出品,必是精品!无需多言,您肯定知道里面只有高质量的科学数据!


主要特点:

  • 数据丰富的属性字段:除化学结构外,每条记录还包含了宝贵的元数据:
    • 化合物性质 – 分子式、质量、组成、类别、地理位置
    • 物理化学数据 – 熔点、旋光
    • 光谱数据 – IR(红外)、HRMS(高分辨质谱)、质谱、UV(紫外),以及使用 Wiley 专有的 NMR(核磁共振)波谱预测算法生成的高质量预测 13C NMR 数据
    • 相关参考文献 – 直接 DOI(数字对象标识符)文献链接,人类代谢组数据库
  • 经过精心策划和慎重评估的数据:从一级和二级文献中收集的数据;之后使用作为数据字段提供的关键参考和来源进行仔细检查及验证。
  • 现在,Wiley的ChemWindow软件也包含在内,用于高阶数据挖掘。
    • 使用ChemWindow的高级数据搜索和挖掘功能搜索整个AntiBase数据集。
    • 此外,还包括多个复杂而成熟的工具,助您完成结构绘图、报告和建立自己的数据库。

2023版中的新内容

  • 增加了5000多种新化合物,扩大了天然化合物库的覆盖范围
  • 人类代谢组数据库(HMDB)的ID现在有了超链接
  • 增加了SMILES字符串
  • 同义词现在有单独的字段

来源可靠的靠谱数据

Wiley是科学数据的权威来源。我们著名的数据库根据严格的协议进行处理,确保其达到最优品质。这些鉴定程序从数据采集开始,贯穿整个数据库开发过程。我们从可信赖的合作伙伴处获取数据,且所有数据需经过全面审查后才能纳入我们的数据库。

库技术指标

  • 天然产品化合物:58,849 
  • 化学结构:56,000 
  • 化合物分类数据:21,911  
  • 来源数据/Origin Data:55,786/9,904
  • Biological Activity Data: 32,147
  • Literature References: 58,179
  • 旋光度 (OR) 值:15,658  
  • 熔点数据:6,965 
  • HMDB 参考: 1,724 
  • MS 数据: 8,310
  • IR 数据: 10,906 
  • H-NMR 数据: 2,211
  • C-NMR 数据: 41,812 
  • UV 数据: 16,613 

兼容性

关于仪器/软件的兼容性,请访问 sciencesolutions.wiley.com/compatibility

  • Wiley Identifier of Natural Products内置并兼容KnowItAll ChemWindow版
  • 也可与您正在使用的其他版本的KnowItAll软件一起使用。

化合物覆盖率

包括来自以下生物来源的化合物:

  • 藻类
  • 动物
  • 细菌
  • 蓝细菌
  • 甲藻
  • 真菌
  • 地衣
  • 霉菌
  • 植物
  • 原生动物
  • 黏菌
  • 酵母菌

科学文献中的用例

Wiley Identifier of Natural Products AntiBase Library在Google Scholar中已被引用1500多次。科学家们在各种应用中使用该数据库的例子不胜枚举,以下仅举几例。

文章标题DOI链接摘要应用领域
Discovery of actinomycin L, a new member of the actinomycin family of antibioticshttps://doi.org/10.1038/s41598-022-06736-0链霉菌生产具有生物活性的天然产物,包括大多数天然生产的抗生素。发现了由MBT27链霉菌产生的两种新的放线菌素类似物,放线菌素L1和L2。
使用Reaxys、ChemSpider和AntiBase进行了去复制。对现有天然产物的质量特征做了注解,而有一个m/z值为1387.6706[M + H]+的质量特征无法与以前报告的任何天然产物相匹配。
抗生素
New Metabolites From the Endophytic Fungus Cercophora samala Associated With Mitragyna inermishttps://doi.org/10.1177/1934578×211013220无刺帽柱木(Mitragyna inermis)是生长在西非的一种小树种,在传统医学中被用来治疗一些疾病。从该树种中分离出两个新的代谢物,通过将它们的光谱数据和AntiBase中报告的数据以及通过DFT计算,阐明了其结构。代谢组学
Combination of high-throughput microfluidics and FACS technologies to leverage the numbers game in natural product discoveryhttps://doi.org/10.1111/1751-7915.13872为了促进天然产物的发现,结合使用液滴微流体和荧光激活细胞分选技术开发了一种筛选方法。该方法用于评估一个微生物环境样本。为了识别天然产物,使用AntiBase进行了分子式搜索。抗菌剂
Screening for biologically active metabolites with endosymbiotic bacilli isolated from arthropodshttps://doi.org/10.1111/j.1574-6968.2002.tb11475.x从各种昆虫和千足虫肠道的不同部分分离出了芽孢杆菌属的内共生菌。对这些样本进行了生物活性代谢物的筛选,并分离出了这些代谢物。通过将NMR和HREI或DCI质谱法相结合,阐明了其结构。其结构系在AntiBase、NMR:Aldrich Library和光谱集( (MS:NIST, WILEY)的辅助下确定。代谢组学
Comprehensive Analysis of the Alternaria Mycobolome Using Mass Spectrometry Based Metabolomicshttps://doi.org/10.1002/mnfr.201900558傅立叶变换离子回旋共振质谱(FTICR-MS)和LC-MS/MS相结合,对三种互隔交链格孢分离物和一种索兰尼链格孢分离物的代谢组进行了非靶标和靶标分析。由于FTICR-MS的超高分辨率,测得的m/z信号分配了独特的分子式。这些分子式与数据库AntiBase和Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes中的条目进行了匹配。真菌提取物的非靶标分析揭示了互隔交链格孢和索兰尼链格孢的次级代谢物的变化。应用靶标LC-MS/MS确定了互隔交链格孢和索兰尼链格孢分离物的二苯-α-吡喃酮、苝醌、腾毒素和细交链孢菌酮酸的生物合成差异。代谢组学
Signalling and Bioactive Metabolites from Streptomyces sp. RK44https://doi.org/10.3390%2Fmolecules25030460使用高分辨率电喷雾电离质谱(HR-ESIMS)和Global Natural Product Social(GNPS)分子网络(MN)[7]对RK44提取物进行化学分析,显示一簇低分子量的代谢物具有250纳米的紫外吸收特征,表明其有一个共同的生色团骨架。使用AntiBase 2017(WILEY)和其他在线数据库(The Natural Products Atlas, ChemSpider)[8,9]进行的数据库去重复化显示,这些代谢物没有在以前的文献中出现过[10,11]。代谢组学
A selective antibiotic for Lyme diseasehttps://doi.org/10.1016/j.cell.2021.09.011使用高效液相色谱法(HPLC)将吸水链霉菌的提取物分离成40个馏分。对这些馏分进行了博氏疏螺旋体生长抑制测试,结果分离出一种分子质量为511 Da的纯化合物(图1A)。结构系通过将质谱(MS)和NMR分析相结合确定(图S1和S2;表S1和S2)。令人惊讶的是,通过对AntiBase数据库进行搜索,发现该化合物是潮霉素A,一种已知的抗生素(图1A)。抗生素
Crude Extracts of Talaromyces Strains (Ascomycota) Affect Honey Bee (Apis mellifera) Resistance to Chronic Bee Paralysis Virushttps://doi.org/10.3390/v15020343病毒是导致全球蜜蜂数量下降的一个重要因素。将真菌中的天然抗病毒化合物引入蜜蜂的饮食中可以限制这类病毒的影响。对被慢性蜜蜂麻痹病毒(CBPV)感染的踝节菌属真菌的七种菌株进行了检查。使用了AntiBase 2017和一个内部参考数据库来缩小分子结构范围并突出相关的化合物。发现了三种提取物(来自菌株B13、B18和B30)可以减轻CBPV的感染并提高蜜蜂的存活率。代谢组学
Sargassum horneri (Turner) C. Agardh Extract Regulates Neuroinflammation In Vitro and In Vivohttps://doi.org/10.3390/cimb44110367研究表明,铜藻可以帮助预防骨质疏松症,控制胆固醇、血压和高脂血症,含有铜藻的化妆品和功能食品被认为具有抗衰老、抗过敏和美白的作用。因此,本文研究了铜藻提取物对小胶质细胞的抗神经炎症作用。使用AntiBase、以前报告的数据和LC-MS/MS分析,确认了铜藻的活性成分。发现铜藻通过抑制p38 MAPK和NF-κB的磷酸化而产生抗神经炎作用,并抑制了LPS注射小鼠大脑中星形胶质细胞和小胶质细胞的激活。抗炎
Fungal Species and Multi-Mycotoxin Associated with Post-Harvest Sorghum (Sorghum bicolor (L.) Moench) Grain in Eastern Ethiopiahttps://doi.org/10.3390/toxins14070473高粱是发展中国家的主要粮食作物,但在田间和收割后阶段,高粱谷物的数量和质量都受到污染性真菌的影响。本文对收割后阶段与高粱粒相关的真菌种类和多种霉菌毒素样本进行了研究。利用AntiBase、以前报告的数据以及对致毒真菌纯培养物的代谢物谱进行研究,已将毒素分入不同的种属。研究表明,高粱粒被共存的几种霉菌毒素严重污染,因此,对农民进行改良高粱生产管理的培训非常重要。霉菌毒素

应用

应用包括但不限于以下领域:

  • 医药/生物技术
  • 药物发现
  • 代谢组学
  • 食品和化妆品
  • 农业
  • 农药
  • 大学研究和教育
  • 抗菌、抗癌、抗真菌研发