AntiBase: The Natural Compound Identifier

Technique: Base de données de structure, GC-MS, IR, LC-MS, RMN, UV-Vis

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Présentation

Recherche antimicrobienne ciblée grâce à une base de données de dépistage à haut débit

Développé à l’origine par le Dr Hartmut Laatsch, la base de données AntiBase: The Natural Compound Identifier est une compilation de produits naturels présentant les propriétés de plus de 48 000 composés et de leurs structures chimiques. Cette base de données indispensable offre la possibilité aux chercheurs de vérifier si un composé présentant des effets antimicrobiens a déjà été étudié et fournit des informations sur l'activité biologique en corrélation avec des données structurelles.

AntiBase inclut les propriétés des composés (formule moléculaire, masse, composition élémentaire, classe du composé), ainsi que des données physico-chimique (point de fusion, rotation optique) et spectroscopiques (spectres UV, 13C-NMR, IR, HRMS et de masse). Les données ont été recueillies dans la littérature primaire et secondaire, puis vérifiées avec soin et validées par rapport à la plupart des références principales et informations sources fournies en tant que champs de données.

Une autre fonctionnalité unique d'AntiBase est l'accès à des spectres 13C-NMR prédits pour les composés pour lesquels aucun spectre mesuré n'est disponible. Comme une recherche de déplacement RMN peut être facilement combinée à une recherche de sous-structure, ces données spectrales renforcent encore la capacité d'AntiBase à différencier facilement des composés similaires. Les spectres RMN de haute qualité prédits ont été produits par l'algorithme de prédiction des spectres RMN breveté de Wiley.

Nouveau! Inclut désormais le logiciel ChemWindow de Wiley: Recherchez toute la collection AntiBase à l’aide des fonctionnalités avancées de recherche et d’exploration de données de ChemWindow. Inclut également les outils renommés de ChemWindow pour le dessin de structure, les rapports et la construction de vos propres bases de données.

Spécifications des bases de données

  • Composés de produits naturels : 48 887
  • Structures chimiques : 48 887
  • Données de classification des composés : 13 724
  • Données sur la source/l’origine : 46 449
  • Valeurs de la rotation optique (RO) : 9 907
  • Données relatives au point de fusion : 6 022
  • Références HMDB : 1 532
  • Valeurs HRMS pour les types d’ions (-H,+H,+Na) : 46 191
  • MS : 755
  • IR : 5 711
  • H-RMN : 1 150
  • C-RMN : 40 768
  • UV: 11 315

Compatibilité

  • Agilent PCD
  • Bruker MetaboScape
  • KnowItAll / ChemWindow

Composés couverts

Composés couverts :
Algues
Animaux
Bactéries
Cyanobactéries
Dinoflagellés
Champignons
Lichens
Myxobactéries
Plantes
Protozoaires
Amibe
Levure